「Metal Gear Solid 3: Snake Eater」는 Naked Snake와 그의 멘토인 The Boss의 첫 이야기이자 METAL GEAR 시리즈 정사 5번째 작품. 잠입지는 대자연에 둘러싸인 정글. Snake는 자신의 장비를 이용해, 주변 환경에 맞는 위장복이나 페이스 페인트를 입어 적의 눈을 속일 수 있는 「카모플라쥬」를 통해 그늘뿐 아니라 독특한 다른 잠입도 가능하다.